Hvað þarf að hafa í huga þegar PCR-blöndur eru pípettaðar?

Til að mögnunarviðbrögð takist vel er nauðsynlegt að einstök efnisþættir viðbragðsins séu til staðar í réttum styrk í hverri blöndu. Þar að auki er mikilvægt að engin mengun eigi sér stað.

Sérstaklega þegar margar efnahvarfa þarf að setja upp hefur verið tileinkað því að útbúa svokallaða aðalblöndu í stað þess að pípetta hvert hvarfefni fyrir sig í hvert ílát. Forstilltar blöndur eru fáanlegar í verslunum, þar sem aðeins sýnisbundnum þáttum (grunni) og vatni er bætt við. Einnig er hægt að útbúa aðalblönduna sjálfur. Í báðum útgáfum er blöndunni dreift í hvert PCR-ílát án sniðmáts og einstöku DNA-sýni er bætt við sérstaklega í lokin.

Notkun aðalblöndu hefur nokkra kosti: Í fyrsta lagi er fjöldi einstakra pípettunarskrefa minnkaður. Þannig er bæði hætta á notendavillum við pípetteringu og hætta á mengun lágmarkuð og að sjálfsögðu sparast tími. Í meginatriðum er nákvæmni pípetteringarinnar einnig meiri þar sem stærri rúmmál eru gefin. Þetta er auðvelt að skilja þegar tæknilegar upplýsingar um pípettur eru skoðaðar: Því minna sem skammtað rúmmál er, því meiri geta frávikin verið. Sú staðreynd að allar blöndur koma úr sama íláti hefur jákvæð áhrif á einsleitni (ef vel blandað). Þetta bætir einnig endurtekningarhæfni tilraunanna.

Þegar aðalblöndunni er útbúið skal bæta við að minnsta kosti 10% auka rúmmáli (t.d. ef 10 undirbúningar eru nauðsynlegar, reiknað út frá 11), þannig að jafnvel síðasta ílátið fyllist rétt. Á þennan hátt er hægt að bæta upp (lítilsháttar) ónákvæmni í pípetteringu og áhrif sýnistaps við skömmtun lausna sem innihalda þvottaefni. Þvottaefni eru í ensímlausnum eins og pólýmerösum og aðalblöndum, sem veldur froðumyndun og leifum á innra yfirborði venjulegs vökva.pípettuoddar.

Eftir því hvaða notkun á að nota og hvaða tegund vökva á að gefa út, ætti að velja rétta pípettunaraðferð (1) og viðeigandi búnað. Fyrir lausnir sem innihalda þvottaefni er mælt með beinu tilfærslukerfi eða svokölluðum „lágri retention“ pípettuoddum sem valkost við loftpúðapípettur. Áhrifin afACE PIPETTE oddurer byggt á sérstaklega vatnsfælnu yfirborði. Vökvar sem innihalda þvottaefni skilja ekki eftir sig leifar að innan og utan, þannig að hægt er að lágmarka tap á lausn.

Auk nákvæmrar skömmtunar allra íhluta er einnig mikilvægt að engin mengun eigi sér stað í blöndunum. Það er ekki nóg að nota rekstrarvörur með mikilli hreinleika, því pípettunarferlið í loftpúðapípettu getur framleitt úðabrúsa sem sitja eftir í pípettunni. DNA sem kann að vera í úðabrúsanum getur flust úr einu sýni í það næsta í næsta pípettunarskrefi og þannig leitt til mengunar. Beinu tilfærslukerfin sem nefnd eru hér að ofan geta einnig lágmarkað þessa áhættu. Fyrir loftpúðapípettur er skynsamlegt að nota síuodda til að vernda pípettekeiluna með því að halda aftur af skvettum, úðabrúsa og lífsameindum.


Birtingartími: 6. des. 2022